Krāsu tintes trūkums ir tas, ka tā nav ūdensizturīga, un, tā kā krāsvielu molekulas ultravioletā starojuma ietekmē ātri sadalās, tā acīmredzami izbalēs viena mēneša laikā pēc izmantošanas ārpus telpām ultravioletā starojuma ietekmē.
Trūkums ir tāds, ka lielākā daļa pigmenta tinšu uz virsmas radīs krāsu materiālu paliekas. Tāpēc, pat drukājot uz glancēta papīra un cita papīra ar plakanu virsmu, nevar izdrukāt spīdīgus attēlus, tāpēc lietām, kas apdrukātas ar pigmenta tinti, parasti nav spīduma. Turklāt pigmenta tintes ražošanas izmaksas ir augstākas, tāpēc arī pārdošanas cena ir augstāka nekā krāsvielu tintes cena, un cenu atšķirība ir vairāk nekā divas līdz četras reizes.
